MFK Karviná en FC Hradec Králové zijn gepromoveerd naar de Tsjechische ePojisteni.cz Liga 2016/2017.
SK Sigma Olomouc II en FK Slavoj Vysehrad zijn gedegradeerd naar de Tsjechische CFL 2016/2017.
Tsjechische NFL 2015/2016
| Pos | Club | P | W | D | L | F | A | GD | Pts |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  MFK Karviná | 28 | 17 | 8 | 3 | 50 | 17 | 33 | 59 |
| 2 |  FC Hradec Králové | 28 | 17 | 8 | 3 | 45 | 16 | 29 | 59 |
| 3 |  1. SC Znojmo | 28 | 17 | 5 | 6 | 62 | 33 | 29 | 56 |
| 4 |  FK Baník Sokolov | 28 | 10 | 11 | 7 | 32 | 26 | 6 | 41 |
| 5 |  FC MAS Táborsko | 28 | 9 | 12 | 7 | 39 | 34 | 5 | 39 |
| 6 |  FK Pardubice | 28 | 10 | 8 | 10 | 29 | 29 | 0 | 38 |
| 7 |  FC Graffin Vlašim | 28 | 9 | 8 | 11 | 35 | 33 | 2 | 35 |
| 8 |  FK Ústí nad Labem | 28 | 8 | 11 | 9 | 39 | 38 | 1 | 35 |
| 9 |  FK Varnsdorf | 28 | 8 | 10 | 10 | 35 | 44 | -9 | 34 |
| 10 |  MFK Frýdek-Místek | 28 | 8 | 9 | 11 | 30 | 37 | -7 | 33 |
| 11 |  SFC Opava | 28 | 6 | 14 | 8 | 34 | 37 | -3 | 32 |
| 12 |  SK Dynamo České Budějovice | 28 | 6 | 14 | 8 | 41 | 48 | -7 | 32 |
| 13 |  FK Fotbal Třinec | 28 | 6 | 9 | 13 | 29 | 41 | -12 | 27 |
| 14 |  SK Sigma Olomouc II | 28 | 5 | 6 | 17 | 23 | 49 | -26 | 21 |
| 15 |  FK Slavoj Vyšehrad | 28 | 6 | 6 | 18 | 20 | 61 | -41 | 20 |